Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnupnQ80W37 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms