Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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