Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

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Length 939 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm7251-201ENSMUST00000182661 1009 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Trak1Q6PD31 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Trak1Q6PD31 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Trak1Q6PD31 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Trak1Q6PD31 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trak1Q6PD31 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm37016-201ENSMUST00000195507 660 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Gm45846-201ENSMUST00000211170 446 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms