Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Tbce-201ENSMUST00000039894 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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PtprdQ64487 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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PtprdQ64487 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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PtprdQ64487 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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PtprdQ64487 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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PtprdQ64487 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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PtprdQ64487 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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PtprdQ64487 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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PtprdQ64487 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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PtprdQ64487 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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PtprdQ64487 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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PtprdQ64487 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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PtprdQ64487 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Gm8991-201ENSMUST00000073014 1075 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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PtprdQ64487 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Gm6225-201ENSMUST00000181558 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Gm3752-202ENSMUST00000167833 450 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Gm10128-201ENSMUST00000171360 615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Gm2956-202ENSMUST00000178722 450 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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