Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Lypd4-201ENSMUST00000079306 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Ces1e-203ENSMUST00000176282 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm15369-201ENSMUST00000119681 394 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm12037-201ENSMUST00000123160 308 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Rbm4-201ENSMUST00000164209 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm3752-202ENSMUST00000167833 450 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm10128-201ENSMUST00000171360 615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm2956-202ENSMUST00000178722 450 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm10340-202ENSMUST00000188235 615 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm38132-201ENSMUST00000193358 707 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Ccdc153-206ENSMUST00000216632 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 CT025603.2-201ENSMUST00000224369 484 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Tssk4-204ENSMUST00000226591 1243 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm9583-201ENSMUST00000219613 1843 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm19114-201ENSMUST00000193972 1357 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Smarce1-ps1-201ENSMUST00000180067 1077 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Ucma-205ENSMUST00000195688 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Calb2-202ENSMUST00000212297 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 AC154766.1-201ENSMUST00000226550 936 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Tmem35b-202ENSMUST00000106097 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 AC139845.1-201ENSMUST00000147013 1334 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Rad52-212ENSMUST00000162461 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm14239-201ENSMUST00000116491 685 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Stard4-202ENSMUST00000118990 648 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm13217-201ENSMUST00000120466 953 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm12738-201ENSMUST00000122349 536 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Mrgpra3-201ENSMUST00000176369 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm3534-201ENSMUST00000182522 1001 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 AC167019.2-201ENSMUST00000227335 845 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm14705-201ENSMUST00000154109 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Skap2-201ENSMUST00000078214 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Tes-201ENSMUST00000076654 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Dcstamp-204ENSMUST00000227792 1367 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Cdrt4os1-202ENSMUST00000153180 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Tmx2-202ENSMUST00000111664 1926 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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