Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Stk38l-202ENSMUST00000111644 2274 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Olfr601-202ENSMUST00000210431 2266 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm42868-201ENSMUST00000199168 2697 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Cnga3-204ENSMUST00000195272 2197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Atg13-201ENSMUST00000028678 3604 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Adamtsl3-203ENSMUST00000173287 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ctns-202ENSMUST00000108476 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Best3-201ENSMUST00000020378 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh1-201ENSMUST00000057185 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Mpp2-201ENSMUST00000017458 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Acad10-201ENSMUST00000031412 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm20658-202ENSMUST00000177059 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Shc4-201ENSMUST00000042246 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Nifk-201ENSMUST00000027626 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Btnl5-ps-201ENSMUST00000097346 1751 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Atp10d-202ENSMUST00000126664 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Wnk4-201ENSMUST00000103108 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Pik3c3-203ENSMUST00000115812 3257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Rmdn2-201ENSMUST00000040368 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 4933416O17Rik-201ENSMUST00000220972 2122 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 AC138284.4-201ENSMUST00000216704 2882 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ins2-202ENSMUST00000105930 583 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Eml1-202ENSMUST00000109857 2627 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Rab44-201ENSMUST00000087942 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Mkl1-203ENSMUST00000131235 4222 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw11-202ENSMUST00000093205 3938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Zfp563-201ENSMUST00000131722 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Slc1a7-201ENSMUST00000106713 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sft2d1Q5SSN7 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
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