Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Perm1Q149B8 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Perm1Q149B8 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Perm1Q149B8 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Perm1Q149B8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Perm1Q149B8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm16499-201ENSMUST00000204648 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms