Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm12619-201ENSMUST00000117369 385 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Il24-201ENSMUST00000121040 1159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm12696-201ENSMUST00000122361 905 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm5652-201ENSMUST00000182336 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm13551-201ENSMUST00000121286 430 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Cdrt4os1-202ENSMUST00000153180 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm5960-201ENSMUST00000188483 406 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm13527-201ENSMUST00000117926 691 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 n-R5s5-201ENSMUST00000083134 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm43585-201ENSMUST00000199375 1403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Spz1-201ENSMUST00000050658 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm42527-201ENSMUST00000198173 1480 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm27383-201ENSMUST00000184418 361 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cux1P53564 AC167565.2-201ENSMUST00000227042 1870 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Dcstamp-204ENSMUST00000227792 1367 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Ighv6-3-201ENSMUST00000103486 356 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Ighv6-6-201ENSMUST00000103489 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm15423-201ENSMUST00000150600 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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