Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm26649-201ENSMUST00000181595 3196 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 4930552P12Rik-201ENSMUST00000181198 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm43615-201ENSMUST00000197465 1773 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3aP47708 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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