Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Gm14326-203ENSMUST00000108932 888 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
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