Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Eif2d-203ENSMUST00000112446 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Klf17-201ENSMUST00000062747 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Ccna1-201ENSMUST00000029368 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Irf9-203ENSMUST00000134863 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Dync1i1-201ENSMUST00000115554 2518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Gm45768-201ENSMUST00000206763 3202 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Slc17a2-202ENSMUST00000099697 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 AC123731.1-201ENSMUST00000227417 1403 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Ptpn20-201ENSMUST00000022508 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 Alox8-201ENSMUST00000021262 3226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Gm20795J3QP49 March1-206ENSMUST00000110256 3288 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Thap2-201ENSMUST00000020346 3681 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Xpo5-201ENSMUST00000087031 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Elmo1-201ENSMUST00000072519 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 AC116589.5-201ENSMUST00000222230 1660 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Xrcc5-201ENSMUST00000027379 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Tnr-201ENSMUST00000111669 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Pik3r3-202ENSMUST00000106490 1830 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Tuba4a-202ENSMUST00000186213 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Gm20795J3QP49 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms