Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms