Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rnf217D3YYI7 4930503B20Rik-201ENSMUST00000049703 2080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rnf217D3YYI7 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rnf217D3YYI7 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rnf217D3YYI7 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rnf217D3YYI7 Cdkl1-201ENSMUST00000021377 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 AC123731.1-201ENSMUST00000227417 1403 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms