Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 1700001J11Rik-202ENSMUST00000190330 2463 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms