Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Kcnip4-206ENSMUST00000175660 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm31182-201ENSMUST00000219061 2391 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Mageb2-201ENSMUST00000101397 1143 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Wdr45-202ENSMUST00000115687 1299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm12464-201ENSMUST00000121385 1016 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm27483-201ENSMUST00000184983 71 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Il19-204ENSMUST00000187916 720 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 1700008N11Rik-201ENSMUST00000209848 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gnpnat1-202ENSMUST00000226276 710 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Mageb1-201ENSMUST00000072269 1143 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Mageb1-202ENSMUST00000099471 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 D330041H03Rik-207ENSMUST00000181760 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Rad54b-201ENSMUST00000070755 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Eef1g-201ENSMUST00000052248 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 E030025P04Rik-201ENSMUST00000106710 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm14010-201ENSMUST00000131961 374 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Lyrm7-205ENSMUST00000144164 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm11464-201ENSMUST00000146963 537 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Tbxas1-206ENSMUST00000162521 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 H2-M5-203ENSMUST00000169189 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm18513-201ENSMUST00000177313 560 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm42538-202ENSMUST00000199431 358 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 9330161L09Rik-201ENSMUST00000056140 999 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm11513-201ENSMUST00000138855 751 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm14225-201ENSMUST00000142310 539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 4930519F09Rik-201ENSMUST00000159347 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Olfr754-ps1-201ENSMUST00000173181 911 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm43903-201ENSMUST00000205126 617 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm18029-201ENSMUST00000219973 844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Tmem14a-201ENSMUST00000027064 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Etfbkmt-204ENSMUST00000111551 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Etfbkmt-201ENSMUST00000047531 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Stard3nl-205ENSMUST00000197565 1391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 n-R5s2-201ENSMUST00000101968 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 n-R5s194-201ENSMUST00000104719 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Magea7-ps-201ENSMUST00000117727 960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Cfap77-202ENSMUST00000157048 1042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 n-R5s112-201ENSMUST00000178208 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 n-R5s125-201ENSMUST00000179377 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 n-R5s120-201ENSMUST00000180000 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm26834-201ENSMUST00000181815 950 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm17813-201ENSMUST00000185377 328 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm8449-201ENSMUST00000185532 988 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NhsB1AV60 Il24-202ENSMUST00000187650 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms