Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm44636-201ENSMUST00000206130 755 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms