Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms