Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Nupl1-201ENSMUST00000225805 3602 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Csnk2a1-201ENSMUST00000099224 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms