Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms