Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
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Pramef8Q8CE24 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Pramef8Q8CE24 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Pramef8Q8CE24 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
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Pramef8Q8CE24 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Pramef8Q8CE24 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Pramef8Q8CE24 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
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Pramef8Q8CE24 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Pramef8Q8CE24 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Pramef8Q8CE24 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Pramef8Q8CE24 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Pramef8Q8CE24 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Pramef8Q8CE24 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Pramef8Q8CE24 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Pramef8Q8CE24 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Pramef8Q8CE24 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Pramef8Q8CE24 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Pramef8Q8CE24 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Pramef8Q8CE24 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pramef8Q8CE24 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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