Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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ChfrQ810L3 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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ChfrQ810L3 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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ChfrQ810L3 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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ChfrQ810L3 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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ChfrQ810L3 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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