Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Syt17-201ENSMUST00000081574 2764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm28177-201ENSMUST00000185516 3532 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Trim2-201ENSMUST00000054990 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Stra6-214ENSMUST00000170397 3077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Wdr77-201ENSMUST00000010278 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Kcna4-201ENSMUST00000037012 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Top3a-203ENSMUST00000117743 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Sdad1-203ENSMUST00000201143 2156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm28048-201ENSMUST00000160826 2746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Ezh2-202ENSMUST00000092648 2115 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Tfrc-202ENSMUST00000120680 1860 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Cnksr3-202ENSMUST00000150282 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm10118-201ENSMUST00000079279 2569 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm16485-201ENSMUST00000104915 3983 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm16206-201ENSMUST00000132485 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Polr3f-202ENSMUST00000110017 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Pla2g5-202ENSMUST00000102511 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Vmn1r201-201ENSMUST00000091730 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Vps8-201ENSMUST00000096191 4952 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 AC153955.4-201ENSMUST00000217069 2752 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Cnga3-201ENSMUST00000027288 3554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm44848-201ENSMUST00000207808 3234 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Rbm12-202ENSMUST00000109604 6635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm44095-201ENSMUST00000204631 1931 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Mboat2-202ENSMUST00000110942 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Ano9-201ENSMUST00000067836 3019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Rnf43-201ENSMUST00000040089 3670 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Il6st-209ENSMUST00000184445 1870 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm14164-202ENSMUST00000128577 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Mink1-204ENSMUST00000102558 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Rhoh-202ENSMUST00000201533 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Olfr156-201ENSMUST00000079234 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm26638-201ENSMUST00000181762 1924 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm1821-201ENSMUST00000111388 685 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms