Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Fhad1-203ENSMUST00000105780 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms