Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm29018-201ENSMUST00000188707 925 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Ifnb1-201ENSMUST00000055671 750 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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PtpreP49446 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PtpreP49446 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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