Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
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