Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 A830005F24Rik-201ENSMUST00000065465 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 1810009J06Rik-201ENSMUST00000076638 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Ces1e-203ENSMUST00000176282 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Spz1-201ENSMUST00000050658 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 2900011O08Rik-201ENSMUST00000056521 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 AC153566.1-201ENSMUST00000216441 2057 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm16365-201ENSMUST00000122987 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm3534-201ENSMUST00000182522 1001 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm43628-201ENSMUST00000197871 1187 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Figla-201ENSMUST00000032070 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm13361-201ENSMUST00000119977 1431 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Chrne-202ENSMUST00000102556 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Cass4-204ENSMUST00000228775 2629 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 H2-Pb-201ENSMUST00000172731 531 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 5031425E22Rik-203ENSMUST00000188328 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm33024-201ENSMUST00000203143 633 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm39481-201ENSMUST00000210379 512 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm45521-201ENSMUST00000211339 676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Cdca8-201ENSMUST00000030690 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Ccr8-201ENSMUST00000048777 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm6457-201ENSMUST00000066378 815 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Rnf183-202ENSMUST00000107454 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Rad52-212ENSMUST00000162461 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm14705-201ENSMUST00000154109 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Sox2ot-211ENSMUST00000197977 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms