Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sema6cQ9WTM3 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sema6cQ9WTM3 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sema6cQ9WTM3 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sema6cQ9WTM3 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sema6cQ9WTM3 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sema6cQ9WTM3 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sema6cQ9WTM3 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sema6cQ9WTM3 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Sema6cQ9WTM3 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sema6cQ9WTM3 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sema6cQ9WTM3 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sema6cQ9WTM3 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sema6cQ9WTM3 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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