Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Fgf9-203ENSMUST00000165526 3593 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm37622-201ENSMUST00000192162 285 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm26930-201ENSMUST00000194874 1244 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm44167-201ENSMUST00000204957 1878 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Calb2-202ENSMUST00000212297 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Ccr8-201ENSMUST00000048777 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Hba-a1-201ENSMUST00000093209 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm45440-201ENSMUST00000209826 1655 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Fsip1-202ENSMUST00000028821 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Amn1-202ENSMUST00000111535 1457 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Scnn1a-207ENSMUST00000177329 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm12551-201ENSMUST00000122073 726 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm13713-201ENSMUST00000139377 703 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Tnni1-208ENSMUST00000154463 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm13713-202ENSMUST00000155472 285 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm23820-201ENSMUST00000158450 300 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm6317-201ENSMUST00000183159 1000 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm7693-201ENSMUST00000183257 988 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm32591-201ENSMUST00000203038 414 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 AC167019.2-201ENSMUST00000227335 845 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Npm1-202ENSMUST00000093201 1192 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Cldn8-201ENSMUST00000049697 2356 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Skap2-201ENSMUST00000078214 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 AC160138.2-201ENSMUST00000220255 1531 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Serpina5-201ENSMUST00000021495 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 4933436P19Rik-201ENSMUST00000217736 1442 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm15894-201ENSMUST00000162828 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Vpreb3-202ENSMUST00000121151 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm16058-201ENSMUST00000124392 427 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Kcne3-204ENSMUST00000179842 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm21917-203ENSMUST00000180309 561 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 2900076A07Rik-201ENSMUST00000180385 914 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm8513-201ENSMUST00000182830 1003 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Platr11-201ENSMUST00000182885 388 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 1700084F23Rik-201ENSMUST00000186662 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Ucma-205ENSMUST00000195688 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm43110-201ENSMUST00000198877 226 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm18129-201ENSMUST00000208834 1044 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 1700008N11Rik-201ENSMUST00000209848 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm7997-201ENSMUST00000210546 980 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 AC118704.1-201ENSMUST00000225022 695 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm44570-201ENSMUST00000207526 3698 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm32849-201ENSMUST00000208696 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms