Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms