Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cldn22Q9D7U6 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cldn22Q9D7U6 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cldn22Q9D7U6 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cldn22Q9D7U6 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cldn22Q9D7U6 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cldn22Q9D7U6 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cldn22Q9D7U6 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cldn22Q9D7U6 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cldn22Q9D7U6 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cldn22Q9D7U6 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cldn22Q9D7U6 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cldn22Q9D7U6 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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