Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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