Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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ChfrQ810L3 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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ChfrQ810L3 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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ChfrQ810L3 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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ChfrQ810L3 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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ChfrQ810L3 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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ChfrQ810L3 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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ChfrQ810L3 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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ChfrQ810L3 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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ChfrQ810L3 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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ChfrQ810L3 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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