Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms