Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Usp30Q3UN04 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Usp30Q3UN04 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Usp30Q3UN04 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Usp30Q3UN04 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Usp30Q3UN04 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Usp30Q3UN04 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Usp30Q3UN04 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Usp30Q3UN04 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Usp30Q3UN04 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Usp30Q3UN04 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Usp30Q3UN04 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Usp30Q3UN04 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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