Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm9979-201ENSMUST00000069457 3005 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Krt78-201ENSMUST00000164932 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Mmrn2-201ENSMUST00000111908 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Zfp58-201ENSMUST00000076123 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Olfr73-202ENSMUST00000129056 3048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Gm18981-201ENSMUST00000185373 1599 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Ccrl2-201ENSMUST00000111888 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Zfp936-203ENSMUST00000202535 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Gm26710-201ENSMUST00000181265 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Ctage5-220ENSMUST00000177225 2872 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 BC017643-202ENSMUST00000106115 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccbe1Q3MI99 Hk1-201ENSMUST00000072357 3639 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Mef2a-208ENSMUST00000156690 5538 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 AU018091-201ENSMUST00000171749 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 B930082K07Rik-201ENSMUST00000181046 2478 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Trpm1-202ENSMUST00000177102 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Stk26-201ENSMUST00000033444 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 AC157476.2-201ENSMUST00000217574 3200 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccbe1Q3MI99 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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