Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms