Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Csf2rb2-201ENSMUST00000096356 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms