Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Celf4-202ENSMUST00000115816 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Ophn1-202ENSMUST00000113826 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 4933427D06Rik-204ENSMUST00000168837 2467 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms