Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms