Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Rad18-203ENSMUST00000113180 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm8310-201ENSMUST00000117526 1193 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Rpsa-ps3-201ENSMUST00000117789 876 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gimap4-203ENSMUST00000118802 771 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm16329-201ENSMUST00000148174 371 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chd1P40201 4930519F09Rik-201ENSMUST00000159347 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Gm38258-201ENSMUST00000191792 675 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Olfr696-ps1-201ENSMUST00000207160 948 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Olfr518-201ENSMUST00000059617 1002 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chd1P40201 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Ido1-201ENSMUST00000033956 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 4930455G09Rik-201ENSMUST00000126231 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Nhej1-201ENSMUST00000152855 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Ciao1-205ENSMUST00000174863 531 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm20717-201ENSMUST00000176762 657 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm45510-201ENSMUST00000210059 638 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 AC152946.3-201ENSMUST00000219424 280 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Copg1-201ENSMUST00000049966 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Ms4a3-201ENSMUST00000112984 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm12250-201ENSMUST00000119467 1274 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Krtap22-2-201ENSMUST00000178913 380 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm43809-201ENSMUST00000200694 338 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Olfr978-201ENSMUST00000057161 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm22054-201ENSMUST00000083395 155 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gprc5d-201ENSMUST00000032327 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Sept2-215ENSMUST00000179353 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Ccnb1ip1-201ENSMUST00000095932 1509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm12664-201ENSMUST00000118306 913 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Mir378b-201ENSMUST00000175244 92 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 250 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Chd1P40201 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm37886-201ENSMUST00000195349 1513 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Rerg-201ENSMUST00000032347 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm4798-201ENSMUST00000218024 1699 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Kif28-201ENSMUST00000131716 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm14487-201ENSMUST00000145413 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm26739-201ENSMUST00000181041 427 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Mocs2-210ENSMUST00000183407 1074 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm28115-201ENSMUST00000188985 360 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Birc3-202ENSMUST00000115672 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm38095-201ENSMUST00000192896 1402 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm43255-201ENSMUST00000198885 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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