Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms