Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf4E9QAP7 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf4E9QAP7 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms