Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Taar7c-ps-201ENSMUST00000122123 1055 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 1810011H11Rik-202ENSMUST00000227060 496 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Snx7-205ENSMUST00000198499 1314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Prune2-202ENSMUST00000223920 1803 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm33351-202ENSMUST00000215428 1677 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 BB014433-203ENSMUST00000179941 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Mfap5-202ENSMUST00000118626 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm11225-201ENSMUST00000118903 1049 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Rsrc1-209ENSMUST00000162693 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Anp32e-207ENSMUST00000170125 413 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 2900076A07Rik-207ENSMUST00000181492 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Car1-203ENSMUST00000181860 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm27500-201ENSMUST00000184331 336 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm15860-203ENSMUST00000197262 360 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm31363-201ENSMUST00000199362 541 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm44744-201ENSMUST00000208234 852 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm36431-202ENSMUST00000209956 687 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 9330159N22Rik-201ENSMUST00000221530 1031 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm14504-201ENSMUST00000119391 1497 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm45440-201ENSMUST00000209826 1655 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm38379-201ENSMUST00000194351 1525 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm15550-201ENSMUST00000120824 1748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Phactr1-202ENSMUST00000110161 1950 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Eda2r-202ENSMUST00000113832 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm5389-201ENSMUST00000120893 1176 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 4930479D17Rik-201ENSMUST00000146754 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm15749-201ENSMUST00000161848 612 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm38320-201ENSMUST00000192767 1281 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm2694-209ENSMUST00000210935 1125 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 AC154506.2-201ENSMUST00000225481 1276 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Olfr1419-201ENSMUST00000087857 1160 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm39312-201ENSMUST00000213586 2195 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Nsg2-202ENSMUST00000093219 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Prdx1-204ENSMUST00000135573 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Calr3-202ENSMUST00000109974 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Pilra-202ENSMUST00000110980 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Srsf5-203ENSMUST00000110352 1491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Srsf5-204ENSMUST00000110354 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Rassf9-201ENSMUST00000055355 1526 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms