Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc166S4R181 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc166S4R181 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc166S4R181 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc166S4R181 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc166S4R181 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc166S4R181 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc166S4R181 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc166S4R181 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc166S4R181 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc166S4R181 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc166S4R181 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc166S4R181 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc166S4R181 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc166S4R181 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc166S4R181 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc166S4R181 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc166S4R181 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc166S4R181 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc166S4R181 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms