Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Homer1Q9Z2Y3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms