Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Robo3Q9Z2I4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Robo3Q9Z2I4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms