Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z280

Pld1, Phospholipase D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld1Q9Z280 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pld1Q9Z280 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pld1Q9Z280 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pld1Q9Z280 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pld1Q9Z280 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pld1Q9Z280 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pld1Q9Z280 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pld1Q9Z280 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pld1Q9Z280 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms