Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ilf3Q9Z1X4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ilf3Q9Z1X4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms