Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ap3b1Q9Z1T1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ap3b1Q9Z1T1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms