Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr4Q9Z1L2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms